Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmed2Q9R0Q3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmed2Q9R0Q3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmed2Q9R0Q3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed2Q9R0Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmed2Q9R0Q3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed2Q9R0Q3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed2Q9R0Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmed2Q9R0Q3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms