Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc6Q9R087 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gpc6Q9R087 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gpc6Q9R087 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc6Q9R087 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc6Q9R087 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc6Q9R087 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms