Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh2d3cQ9QZS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh2d3cQ9QZS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh2d3cQ9QZS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d3cQ9QZS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms