Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afyQ9QZQ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2afyQ9QZQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afyQ9QZQ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afyQ9QZQ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2afyQ9QZQ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2afyQ9QZQ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms