Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pkp3Q9QY23 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkp3Q9QY23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pkp3Q9QY23 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkp3Q9QY23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp3Q9QY23 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp3Q9QY23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp3Q9QY23 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp3Q9QY23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms