Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnip3Q9QXT8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms