Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copg2Q9QXK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copg2Q9QXK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg2Q9QXK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copg2Q9QXK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Copg2Q9QXK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copg2Q9QXK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Copg2Q9QXK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms