Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm4Q9QXA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsm4Q9QXA5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm4Q9QXA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm4Q9QXA5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lsm4Q9QXA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms