Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul3Q9JLV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cul3Q9JLV5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cul3Q9JLV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cul3Q9JLV5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cul3Q9JLV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul3Q9JLV5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul3Q9JLV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms