Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm1Q9JLF6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgm1Q9JLF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgm1Q9JLF6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm1Q9JLF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm1Q9JLF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms