Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alyref2Q9JJW6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alyref2Q9JJW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alyref2Q9JJW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Alyref2Q9JJW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms