Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacng3Q9JJV5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacng3Q9JJV5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacng3Q9JJV5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacng3Q9JJV5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacng3Q9JJV5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacng3Q9JJV5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacng3Q9JJV5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms