Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrlQ9JJU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bgrlQ9JJU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrlQ9JJU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms