Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ascl3Q9JJR7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ascl3Q9JJR7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ascl3Q9JJR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ascl3Q9JJR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ascl3Q9JJR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ascl3Q9JJR7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ascl3Q9JJR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ascl3Q9JJR7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms