Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW4

Polm, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolmQ9JIW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolmQ9JIW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolmQ9JIW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolmQ9JIW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolmQ9JIW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolmQ9JIW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolmQ9JIW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms