Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LratQ9JI60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LratQ9JI60 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LratQ9JI60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LratQ9JI60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LratQ9JI60 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LratQ9JI60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LratQ9JI60 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LratQ9JI60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LratQ9JI60 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LratQ9JI60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LratQ9JI60 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms