Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpxQ9JHS4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpxQ9JHS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ClpxQ9JHS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ClpxQ9JHS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClpxQ9JHS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClpxQ9JHS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms