Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copz2Q9JHH9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copz2Q9JHH9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz2Q9JHH9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copz2Q9JHH9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz2Q9JHH9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Copz2Q9JHH9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms