Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp6Q9ESX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp6Q9ESX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp6Q9ESX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp6Q9ESX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sp6Q9ESX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp6Q9ESX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms