Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pgpep1Q9ESW8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pgpep1Q9ESW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pgpep1Q9ESW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pgpep1Q9ESW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pgpep1Q9ESW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms