Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aff4Q9ESC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Aff4Q9ESC8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aff4Q9ESC8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aff4Q9ESC8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aff4Q9ESC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aff4Q9ESC8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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