Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufa13Q9ERS2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa13Q9ERS2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa13Q9ERS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa13Q9ERS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndufa13Q9ERS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufa13Q9ERS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms