Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3fQ9DCH4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif3fQ9DCH4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif3fQ9DCH4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif3fQ9DCH4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif3fQ9DCH4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eif3fQ9DCH4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms