Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MNCb-2875Q9DCB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MNCb-2875Q9DCB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MNCb-2875Q9DCB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MNCb-2875Q9DCB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms