Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmg20aQ9DC33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmg20aQ9DC33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20aQ9DC33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20aQ9DC33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20aQ9DC33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms