Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erv3Q9DAX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erv3Q9DAX3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erv3Q9DAX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erv3Q9DAX3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erv3Q9DAX3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Erv3Q9DAX3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Erv3Q9DAX3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms