Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf654Q9DAU9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf654Q9DAU9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Znf654Q9DAU9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Znf654Q9DAU9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf654Q9DAU9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf654Q9DAU9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf654Q9DAU9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms