Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700109H08RikQ9D9C0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700109H08RikQ9D9C0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700109H08RikQ9D9C0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700109H08RikQ9D9C0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700109H08RikQ9D9C0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms