Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lin37Q9D8N6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lin37Q9D8N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lin37Q9D8N6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lin37Q9D8N6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lin37Q9D8N6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms