Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Derl3Q9D8K3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Derl3Q9D8K3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Derl3Q9D8K3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Derl3Q9D8K3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms