Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Med8Q9D7W5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Med8Q9D7W5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med8Q9D7W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med8Q9D7W5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med8Q9D7W5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med8Q9D7W5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med8Q9D7W5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms