Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop56Q9D6Z1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop56Q9D6Z1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop56Q9D6Z1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nop56Q9D6Z1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop56Q9D6Z1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop56Q9D6Z1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nop56Q9D6Z1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nop56Q9D6Z1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms