Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc9bQ9D6E4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttc9bQ9D6E4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc9bQ9D6E4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc9bQ9D6E4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc9bQ9D6E4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttc9bQ9D6E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttc9bQ9D6E4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttc9bQ9D6E4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc9bQ9D6E4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc9bQ9D6E4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc9bQ9D6E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc9bQ9D6E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc9bQ9D6E4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms