Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3a3Q9D554 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3a3Q9D554 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3a3Q9D554 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sf3a3Q9D554 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a3Q9D554 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a3Q9D554 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms