Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc130Q9D516 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc130Q9D516 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc130Q9D516 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc130Q9D516 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc130Q9D516 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc130Q9D516 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc130Q9D516 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms