Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox2aQ9D4Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox2aQ9D4Y3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox2aQ9D4Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2aQ9D4Y3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhox2aQ9D4Y3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rhox2aQ9D4Y3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhox2aQ9D4Y3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox2aQ9D4Y3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms