Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus10Q9D3U0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pus10Q9D3U0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pus10Q9D3U0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pus10Q9D3U0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pus10Q9D3U0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pus10Q9D3U0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pus10Q9D3U0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pus10Q9D3U0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms