Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tchhl1Q9D3P1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tchhl1Q9D3P1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tchhl1Q9D3P1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tchhl1Q9D3P1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tchhl1Q9D3P1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tchhl1Q9D3P1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tchhl1Q9D3P1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tchhl1Q9D3P1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tchhl1Q9D3P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms