Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed11Q9D2R4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed11Q9D2R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed11Q9D2R4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmed11Q9D2R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed11Q9D2R4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms