Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim42Q9D2H5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim42Q9D2H5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim42Q9D2H5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim42Q9D2H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim42Q9D2H5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim42Q9D2H5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim42Q9D2H5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms