Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm12Q9D0R8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm12Q9D0R8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm12Q9D0R8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsm12Q9D0R8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lsm12Q9D0R8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lsm12Q9D0R8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsm12Q9D0R8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsm12Q9D0R8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lsm12Q9D0R8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsm12Q9D0R8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms