Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chaf1bQ9D0N7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chaf1bQ9D0N7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chaf1bQ9D0N7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1bQ9D0N7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1bQ9D0N7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chaf1bQ9D0N7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms