Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mrto4Q9D0I8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mrto4Q9D0I8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrto4Q9D0I8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrto4Q9D0I8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrto4Q9D0I8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrto4Q9D0I8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrto4Q9D0I8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrto4Q9D0I8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrto4Q9D0I8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms