Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E1

Hnrnpm, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpmQ9D0E1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HnrnpmQ9D0E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
HnrnpmQ9D0E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HnrnpmQ9D0E1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HnrnpmQ9D0E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HnrnpmQ9D0E1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HnrnpmQ9D0E1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HnrnpmQ9D0E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HnrnpmQ9D0E1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HnrnpmQ9D0E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
HnrnpmQ9D0E1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.8■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
HnrnpmQ9D0E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms