Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl35Q9CZ49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl35Q9CZ49 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl35Q9CZ49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl35Q9CZ49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl35Q9CZ49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl35Q9CZ49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.6 ms