Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmed5Q9CXE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmed5Q9CXE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmed5Q9CXE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmed5Q9CXE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed5Q9CXE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tmed5Q9CXE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms