Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mgme1Q9CXC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mgme1Q9CXC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mgme1Q9CXC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mgme1Q9CXC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mgme1Q9CXC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mgme1Q9CXC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mgme1Q9CXC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mgme1Q9CXC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mgme1Q9CXC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mgme1Q9CXC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mgme1Q9CXC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms