Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnih4Q9CX13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnih4Q9CX13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnih4Q9CX13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnih4Q9CX13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnih4Q9CX13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnih4Q9CX13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnih4Q9CX13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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