Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Utp23Q9CX11 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Utp23Q9CX11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Utp23Q9CX11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Utp23Q9CX11 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Utp23Q9CX11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Utp23Q9CX11 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms