Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ist1Q9CX00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ist1Q9CX00 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ist1Q9CX00 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ist1Q9CX00 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ist1Q9CX00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ist1Q9CX00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ist1Q9CX00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms